Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA9Q9UGM1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA9Q9UGM1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA9Q9UGM1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA9Q9UGM1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA9Q9UGM1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA9Q9UGM1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA9Q9UGM1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA9Q9UGM1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNA9Q9UGM1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA9Q9UGM1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms