Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms