Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms