Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms