Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXL2Q9NZ53 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms