Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms