Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00846Q9NV44 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00846Q9NV44 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms