Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNPLA3Q9NST1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms