Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms