Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms