Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL1Q9NSC2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms