Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRKQ9NRH2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms