Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms