Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms