Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms