Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms