Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms