Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP1Q9BWH6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP1Q9BWH6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms