Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms