Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms