Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms