Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED4Q96RK1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms