Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms