Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms