Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms