Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NSMCE2Q96MF7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms