Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms