Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms