Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms