Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC1Q96C34 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms