Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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