Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATA6Q92908 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms