Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms