Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ELF3-203ENST00000367284 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 UBR5-AS1-201ENST00000499653 2048 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 C1orf27-203ENST00000419367 1900 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AC245297.3-201ENST00000611769 838 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms