Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms