Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TMIEQ8NEW7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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TMIEQ8NEW7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TMIEQ8NEW7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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TMIEQ8NEW7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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TMIEQ8NEW7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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TMIEQ8NEW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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