Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms