Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms