Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms