Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2Q1Q7Z7E8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms