Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms