Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM72Q6ZMU5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM72Q6ZMU5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms