Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms