Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms