Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms