Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms