Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP9Q5VTM2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms