Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF648Q5T619 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms