Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms