Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C17orf58Q2M2W7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms